O Programa Nacional de DST e Aids utiliza-se da notificação de casos de aids gerados do registro universal e compulsório no Sistema de Informações de Agravos de Notificação (SINAN), bem como do número de óbitos, registrados no Sistema de Informações de Mortalidade (SIM), ambos fornecidos pelo DATASUS. Além disso, gerencia quatro sistemas - o Sistema de Controle de Exames Laboratoriais (SISCEL), o Sistema de Controle Logístico de Medicamentos (SICLOM), o Sistema de Monitoramento de Insumos de Prevenção (PREVINI) e o Sistema de Informação para Rede de Genotipagem (SISGENO) - que compõem o Sistema de Informação em Saúde deste Ministério.
